Такое случается, если вы используете фокусировку на объекте (Space+G). В этом режиме Гудини автоматом подстраивает клиппинг под размер объекта, что приводит к непредсказуемым результатам.
Это поведение можно отключить в настройках вьюпорта. Входим в настройки (клавиша D над вьюпортом), выбираем меню View. Там нас интересует раздел Clipping. Можно включить Homing Auto Adjust в Neither clip plane и вручную вписать нужные параметры клиппинга в параметры Near/Far Clip Planes.
Если же у вас включена и залочена камера, то эти параметры нужно менять уже на ней, во вкладке View — Near Clipping/Far Clipping.